工程训练中心党的组织机构于1999年隶属于北京航空航天大学机关党委领导，由张兴华担任党支部书记，工程训练中心党的建设从此迈向新的里程。北京航空航天大学工程训练中心直属党支部成立于2010年1月19日，由胡殿明同志担任第一任党支部书记。

2019年6月24日，北航学院工程训练中心教师党支部正式成立，共有22名正式党员。6月25日，党支部召开党员大会，选举产生第一届支部委员会：支部书记齐海涛、副书记郝继峰、组织委员邱玉婷、宣传委员李烨、纪检委员韩永鹏。2022年10月26日北京航空航天大学北航学院工程训练中心教师党支部召开党员大会，选举产生第二届支部委员会，支部书记齐海涛，副书记袁媛，纪检委员郝继峰，组织委员兼党务秘书邱玉婷，宣传委员李烨。本支部现有24名正式党员，在中心各项工作中起到了很好地模范带头作用。